Parafia Matki Bożej Łaskawej w Toruniu - Czerniewicach została wyłoniona z parafii Opatrzności Bożej w Toruniu Rudaku. W 1981 r. Kuria Metropolitarna w Gnieźnie wystąpiła do Wydziału ds. Wyznań Urzędu Wojewódzkiego w Toruniu z prośbą o zezwolenie na budowę domu katechetycznego. Wiosną 1982 r. Prymas Polski kard. Józef Glemp poświęcił krzyż na terenie przyszłej budowy, a wiosną 1983 r. pod kierownictwem proboszcza parafii pw. Opatrzności Bożej ks. Jana Sikorskiego rozpoczęto budowę. Pierwszą Mszę św. w piwnicy pod częścią mieszkalną obiektu odprawił wiosną 1994 r. ks. prał. Józef Batkowski z Torunia - Podgórza. Jesienią 1983 r. samowolną decyzją władzy kościelnej zmieniono funkcję budowanego obiektu z katechetyczno-mieszkalnego na sakralno-katechetyczny z częścią mieszkalną i wykonano dach dwuspadowy nad częścią, gdzie zaplanowano kościół. W kwietniu 1984 r. Wydział Architektury i Gospodarki Przestrzennej wstrzymał roboty budowlane do czerwca 1986 r. Decyzją Kurii Metropolitarnej w Gnieźnie z 28 sierpnia 1984 r. przyszły kościół otrzymał wezwanie - tytuł Matki Bożej Łaskawej, a dekretem Prymasa Polski kard. Józefa Glempa z 8 grudnia 1984 r. została erygowana parafia na terenie osiedla Czerniewice i części Brzozy.
1 stycznia 1985 r. pierwszym proboszczem parafii został mianowany ks. Leon Ulatowski. Pierwsza Msza św., w surowych jeszcze murach nowej świątyni, została odprawiona w sobotę przed Niedzielą Palmową w 1985 r. Tego samego roku został zawieszony obraz Matki Bożej Łaskawej. W 1988 r. otynkowano wnętrze kościoła, wykonano drewniany sufit i zainstalowano oświetlenie, a 5 grudnia kard. Józef Glemp dokonał poświęcenia murów świątyni i obrazu Patronki kościoła. 25 marca 1992 r. w związku z reorganizacją struktur kościelnych w Polsce parafia przeszła z archidiecezji gnieźnieńskiej do nowo powstałej diecezji toruńskiej.
W 1999 r. postawiono dzwonnicę i umieszczono na niej 430-kilogramowy dzwon poświęcony 7 czerwca przez Papieża Jana Pawła II, w czasie jego wizyty w Toruniu. Jesienią 1999 r. zostały przeprowadzone misje ewangelizacyjne. W roku 2000 zamontowano nowe ławki. W roku 2001 zmieniono nagłośnienie w kościele, zamontowano nowe tabernakulum, główną ścianę prezbiterium częściowo obłożono zielonym marmurem oraz wykonano z marmuru ołtarz i ambonkę.
11 września 2002 r. parafię odwiedził metropolita poznański abp Stanisław Gądecki, który w kościele odprawił Mszę św. wspólnie z kapłanami z rocznika święceń Księdza Leona.
Przed samą konsekracją w 2003 r. wykonano marmurową chrzcielnicę i nową zabudowę zakrystii. Dzisiaj kościół lśni czystością i zachwyca elegancją. Parafianie dbają, aby przed ołtarzem były zawsze świeże kwiaty. Także teren wokół kościoła może służyć jako przykład, piękne, zawsze przystrzyżone trawniki i mnóstwo gatunków zielonych roślin iglastych. Wszystko to sprawia, że do kościoła chętnie przybywają nie tylko parafianie. Mimo iż na pierwszy rzut oka wszystko wydaje się już ukończone, Ksiądz Proboszcz mówi, że jeszcze wiele trzeba zrobić, aby świątynia i jej otoczenie były jeszcze piękniejsze.
Kościół to nie tylko budynek. Parafia rozwija się także jako wspólnota. Przy ołtarzu dzielnie posługuje ok. 30 ministrantów i lektorów, prężnie działają także wspólnoty Żywego Różańca i Stowarzyszenia Rodzin Katolickich, które w ciągu roku przygotowują rozmaite akcje duszpasterskie. Największym wydarzeniem jest zawsze festyn parafialny, który gromadzi zwykle większość parafian na wspólnej modlitwie i zabawie.
Do najważniejszych zadań duszpasterskich należy przede wszystkim większe włączenie w życie parafii mieszkańców nowego osiedla, które zostało wybudowane na jej terenie.
Dużą radością - jak mówi ks. kan. Leon Ulatowski - jest wstąpienie w tym roku do Wyższego Seminarium Duchownego w Toruniu trzech czerniewickich parafian.